研究报告

亚洲棉、雷蒙德棉和陆地棉 NRAMP 基因家族的鉴定和进化分析  

卢婷婷 , 王文佳 , 李存法 , 侯春彬
1 河南牧业经济学院, 郑州, 450046; 2 河南大学生命科学学院, 植物逆境国家重点实验室, 棉花生物学国家重点实验室, 开封, 475004
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2018年06月12日    接受日期: 2018年07月18日    发表日期: 2019年05月09日
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摘要

自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族是跨膜转运蛋白家族,参与多种金属离子的转运过程。为了更好了解棉花 NRAMP 基因的成员和特征,二倍体和四倍体棉花之间的进化关系,本研究利用二倍体亚洲棉、雷蒙德棉和陆地棉基因组的氨基酸序列对三个棉种中的 NRAMP 家族成员进行鉴定,分析了 NRAMP家族的种类、理化性质、进化关系、基因结构、蛋白基序、染色体定位、共线性关系和选择压力。结果显示,在二倍体亚洲棉基因组(A)中确定 12 个成员,在二倍体雷蒙德棉基因组(D)中确定 15 个成员,在四倍体陆地棉基因组(At, Dt)中确定 23 个成员。按照进化关系的远近将这 50 个成员分为 3 个亚类,进化关系较近的成员之间具有更为相似的理化性质、基因结构和蛋白质基序;通过和其他植物的进化关系分析发现,NRAMP 基因
在单子叶和双子叶植物分离前已经产生;染色体定位发现
NRAMP 在染色体上的分布并不规律;共线性分析和选择压力分析表明,片段复制在棉花 NRAMP 基因的遗传进化过程中发挥主导作用,同源基因对在进化过程中处于纯化选择。

关键词
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP);基因家族;鉴定;进化分析;棉花(Gossypium)

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《分子植物育种》印刷版
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